Sebagai bagian dari Universitas Muhammadiyah Pontianak, Fakultas Agama Islam menetapkan visi dan misi sebagai arah pengembangan kelembagaan serta pedoman dalam penyelenggaraan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat. Visi dan misi ini menjadi landasan dalam membentuk lulusan yang memiliki kompetensi akademik sekaligus integritas keislaman.
Visi
Menjadi fakultas yang unggul dalam mengembangkan studi ke-Islaman berbasis IPTEKS dan IMTAQ di Kalimantan Barat.
Misi
- Melaksanakan pembelajaran berbasis IPTEKS dan IMTAQ.
- Melaksanakan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat untuk kemaslahatan umat.
- Mengembangkan pemanfaatan ilmu-ilmu ke-Islaman untuk peningkatan dan pemberdayaan sumber daya manusia di Kalimantan Barat.
Visi dan misi tersebut menjadi komitmen Fakultas Agama Islam dalam menjalankan peran strategisnya sebagai lembaga pendidikan tinggi Islam yang berkontribusi terhadap pengembangan ilmu pengetahuan serta kemajuan masyarakat di Kalimantan Barat.